Plantematerialer er omdannet til tørv, som er blevet udnyttet til brændsel fra slutningen af 1700-tallet. Efter anden verdenskrig ophørte tørvegravningen og mosen blev drænet.
Mosen er på ca. 26 hektar og tidligere en højmose, der er dannet efter sidste istid. Overalt bærer mosen præg af tørvegravning i form af dybe damme, som der findes et halvt hundrede af i området.
Fund fra yngre stenalder og yngre bronzealder vidner om aktivitet i og omkring mosen.
Den lange, lige Carlsberg-grøft er et resultat af et stort regulerings- og uddybningsarbejde, der blev gennemført som beskæftigelsesarbejde i 1940’erne. Regulering og uddybning af Brugsgård Møllebæk, Carlsberg-grøften og grøften gennem mosen betød, at vandstanden i Paderup Mosen med ét blev sænket med ca. en meter. Et indgreb som har haft gennemgribende indvirkning på flora og fauna i området - en skæbne som deles med størsteparten af Danmarks tidligere højmoser.
